21:48
Comentarii Adauga Comentariu

_ Noul instrument de simulare avansează modelarea moleculară a condensatelor biomoleculare

_ Noul instrument de simulare progresează modelarea moleculară a condensatelor biomoleculare

O echipă de la Universitatea din Massachusetts Amherst a făcut un progres major în ceea ce privește modelarea și înțelegerea modului în care proteinele intrinsec dezordonate (IDP) suferă separarea spontană a fazelor, un mecanism important de organizare subcelulară care stă la baza numeroaselor funcții biologice. și bolile umane.

PDI joacă un rol crucial în cancer, tulburări neurodegenerative și boli infecțioase. Ele reprezintă aproximativ o treime din proteinele pe care corpul uman le produce, iar două treimi din proteinele asociate cancerului conțin segmente sau domenii mari, dezordonate. Identificarea trăsăturilor ascunse esențiale pentru funcționarea și auto-asamblarea PDI-urilor va ajuta cercetătorii să înțeleagă ce merge prost cu aceste caracteristici atunci când apar boli.

Într-o lucrare publicată în Journal of the American Chemical Society, autor principal Jianhan Chen, profesor de chimie, descrie o modalitate nouă de a simula separările de fază mediate de IDP, un proces important care a fost dificil de studiat și descris.

„Separarea de fază este un fenomen cu adevărat binecunoscut în polimeri. fizică, dar ceea ce oamenii nu știau până acum aproximativ 15 ani era că acesta este, de asemenea, un fenomen cu adevărat comun în biologie”, explică Chen. „Puteți să vă uitați la separarea fazelor cu un microscop, dar este foarte dificil să înțelegeți acest fenomen la nivel molecular.

„În ultimii cinci sau 10 ani, oamenii au început să descopere că multe dintre acestea au dezordonat proteinele pot determina separarea fazelor, inclusiv numeroasele importante implicate în cancer și tulburări neurodegenerative.”

Noua lucrare, bazată pe cercetări din laboratorul de biofizică computațională și biomateriale al lui Chen, constituie un capitol al doctoratului principal al autorului Yumeng Zhang. D. disertație. Zhang va începe să lucreze ca cercetător postdoctoral la Massachusetts Institute of Technology (MIT) în februarie. Un alt contributor cheie este Shanlong Li, un asociat de cercetare postdoctorală în laboratorul lui Chen.

Laboratorul lui Chen a dezvoltat un studiu precis , Câmp de forță de rezoluție hibridă accelerată de GPU (HyRes) pentru simularea separărilor de fază mediate de IDP. Acest model este unic prin capacitatea sa de a descrie cu precizie interacțiunile scheletului peptidic și structurile secundare tranzitorii, fiind în același timp suficient de eficient din punct de vedere computațional pentru a modela separarea fază lichid-lichid. Acest nou model umple un gol critic în capacitatea existentă de simulare pe computer a separării fazelor IDP.

Chen și echipa au creat simulări HyRes pentru a demonstra pentru prima dată ce guvernează stabilitatea condensului a două IDP importante.

p>

„De fapt, nu am anticipat că ar putea face o treabă atât de bună în a descrie separarea fazelor, deoarece este un fenomen cu adevărat dificil de simulat”, spune Chen. „Am demonstrat că acest model este suficient de precis pentru a începe să analizăm impactul chiar și al unei singure mutații sau structurilor reziduale în separarea fazelor.”

HyRes-GPU al cercetătorilor oferă un instrument inovator de simulare pentru studiul mecanisme moleculare de separare a fazelor. Scopul final este de a dezvolta strategii terapeutice în tratamentul bolilor asociate cu proteinele dezordonate.

„Acesta este cu adevărat semnificația acestei lucrări”, spune Chen. „Se crede că procesele biologice importante apar prin separarea fazelor. Deci, dacă putem înțelege mai bine ce controlează acest proces, aceste cunoștințe vor fi cu adevărat puternice, dacă nu esențiale, pentru ca noi să ne gândim la controlul separării fazelor pentru diverse scopuri științifice și de inginerie. Acest lucru ne va ajuta să înțelegem tipul de intervenție care va fi necesară pentru a obține efecte terapeutice.”

Chen spune că următorul pas este să aplicăm ceea ce echipa sa a învățat la simulări la scară mai mare ale amestecurilor biomoleculare mai complexe.

„Shanlong lucrează acum la construirea unui model similar pentru acizii nucleici, deoarece separarea fazelor implică adesea atât proteine ​​dezordonate, cât și acizi nucleici”, spune el. „Vrem să putem descrie ambele componente cheie și asta ne-ar permite să privim mai multe sisteme.”


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Principalul editor abandonează planurile pentru Cartea Președinției Biden

_ Sonda lunară din Japonia supraviețuiește celei de-a doua nopți lunare

_ Momentul Minsky al Americii se apropie

_ Greg Gutfeld: Democraților le pasă mai mult de criminali decât de tine (VIDEO)

_ Guvernatorul Illinois JB Pritzker se laudă cu alegerile din Illinois și este batjocorit cu sălbăticie

_ Japonezii, omorâţi de produse din orez roşu. S-a pornit dezbatere naţională

_ 10 tradiții de Paște în întreaga lume

_ Brittney Griner şi Sabrina Ionescu, convocate pentru un stagiu al echipei olimpice a SUA

_ Îmbunătățirea relațiilor SUA-Rusia „imposibilă” sub Biden, spune ambasadorul

_ Opt state plănuiesc să interzică vânzarea de vehicule pe gaz, în timp ce Joe Biden emite noi reguli pentru a începe să le omoare

_ Drumul spre un nou macarthyism

_ Flip-flopping-ul Martor al demiterii lui Trump se înregistrează ca agent străin al Ucrainei, pretinde loialitate „încă 100% față de Statele Unite”

_ Cel mai slab sistem stelar cunoscut care orbitează Calea Lactee a fost descoperit

_ Calea dezinflaționistă se blochează pe măsură ce prețurile bunurilor de durabilitate cresc, dar PCE supercore alunecă

_ Israelul ar putea tăia băncile palestiniene din sistemul bancar global săptămâna viitoare

_ Modelul sugerează modul în care ARN-ul antic ar fi putut dobândi capacitatea de auto-tăiere esențială pentru viață

_ O nouă analiză dezvăluie o mică gaură neagră care străpunge în mod repetat discul de gaz al unei găuri negre mai mari

_ McDonald's anunță o schimbare majoră la Happy Meal - și reduce prețul la timp pentru Sărbătorile de Paște

_ Cel mai longeviv măcelar din Marea Britanie, în vârstă de 85 de ani, își închide satarul pentru carne după 66 de ani - în timp ce dă vina pe creșterea veganismului și a preocupărilor ecologice pentru scăderea comerțului

_ Trei pulsari noi în milisecunde au fost detectate cu MeerKAT

_ Când inegalitatea este mai mult decât „până la nivelul pielii”: statutul social lasă urme în epigenomul hienelor pete din Tanzania

_ Războiul din Ucraina, ziua 765. Forţele ruse atacă infrastructura din zonele critice / Kiev: 99 de bombe ruseşti trimise spre centralele termice / Lavrov respinge planul de pace al Ucrainei

_ General ucrainean: Ucraina va mobiliza mai puţini oameni decât se estima

_ Fed din Philadelphia recunoaște că salariile din SUA sunt supraevaluate cu cel puțin 800.000

_ Bolnav: Biden face o glumă despre câinii săi care atacă agenții serviciilor secrete

_ Avocații pentru frontierele deschise și mass-media armează moartea a șase muncitori imigranți uciși în prăbușirea podului Francis Scott Key

_ Fostul ministru chinez al comerțului, care l-a susținut pe Trump, avertizează SUA că „demontarea” comerțului global suflă înapoi pe americanii obișnuiți

_ Putin amenință că va ataca bazele aeriene occidentale care găzduiesc avioane F-16 ucrainene

_ Autorul Coleman Hughes întoarce lucrurile și o demolează pe co-gazda lui The View, Sunny Hostin, după ce l-a numit „pion” pentru promovarea unei societăți de daltonism (VIDEO)

_ Biden a fost prăjit pentru un tweet surd care l-a atacat pe Trump, în timp ce fostul prez asistă la veghea pentru ofițerul NYPD ucis

_ O euharistie din aluat sau napolitană? Ce ne spune o ceartă religioasă de o mie de ani despre fermentație

_ ALMA găsește noi semne moleculare în galaxia Starburst

_ Cercetatorii descopera sistemul de reglementare care regleaza modelele de ramificare in tesutul epitelial pulmonar

_ Nouă variabilă cataclismică descoperită de astronomi

_ Noul hidrogel se poate întinde până la de 15 ori dimensiunea inițială

_ Cercetarea supergenelor rezolvă misterul mătcilor furnici

_ Progrese promițătoare în membranele organosilice pentru separarea amestecurilor lichide organice

_ Ar trebui să-ți interzici familia de pe smartphone-uri? HARRY WALLOP a făcut exact asta - cu rezultate FOARTE surprinzătoare

_ Droguri 'home-made', distribuite într-o sală de fitness din Cluj-Napoca

_ Acțiunile asiatice câștigă cu închisoarea din SUA și Europa înainte de Core PCE Print, Powell Speech

_ Ce va face Fed în continuare?

_ DeSantis pune capăt odată pentru totdeauna ��nșelătoriei de ocupători� prin semnarea unei noi legi

_ Fotografia orizontului orașului New York din Vinerea Mare 1956 arată cât de mult s-au schimbat SUA

_ Trump va aborda „Baia de sânge la graniță a lui Biden” în Grand Rapids, Michigan, la câteva zile după ce un străin ilegal deportat anterior a fost acuzat de uciderea unei tinere, Ruby Garcia

_ Cicatrice cardiacă detectată la peste 1 an după vaccinarea împotriva COVID-19: studii

_ Tom Sodeika, fondatorul Freedom Square, se alătură lui Rose Unplugged pentru a discuta despre modul în care „Cancel Culture” s-a mutat în sistemul nostru bancar (AUDIO)

_ UPDATE: Obama îl apără pe Biden după ce protestatarii întrerup strângerea de fonduri „Grassroots” de 25 de milioane de dolari Biden-Obama-Clinton din New York City

_ Denunțătorul Hunter Biden, Tony Bobulinski, îl dă în judecată pe gazda liberală Fox News – „Minciunile au consecințe”

_ Biden a emis luna trecută un ordin executiv pentru a consolida securitatea cibernetică în porturile din SUA

_ SUA depășește plafonul prețului petrolului de 79 USD în ultima achiziție SPR

_ Guvernatorul Idaho semnează un proiect de lege care interzice utilizarea Medicaid și a asigurărilor de stat pentru tratamente de schimbare a sexului

_ Crearea unui AGI „bun” care nu ne va ucide pe toți: Alianța de Superintelligence Artificială a Crypto

_ Urmăriți: Gazdele „The View” se topesc din cauza faptului că Trump vinde biblii, susțin că aduce „fascismul în America”

_ Alegătorii supleanți pro-Trump din Arizona pledează al cincilea ÎNAINTE MARELE JURIU, în timp ce procurorul general democrat Kris Mayes cântărește acuzațiile penale

_ În pragul unei schimbări dramatice: digitalizarea banilor

_ Matt Walsh abordează „coincidența” noului film al lui Obama, care conține scena în care o navă de marfă se prăbușește din cauza atacului cibernetic și a prăbușirii podului Baltimore Key (VIDEO)

_ JUST IN: Comer *invită* Joe Biden să depună mărturie în fața Comisiei de Supraveghere despre schema de trafic de influență a familiei sale

_ Cum conchistadorii spanioli și o mică insectă care locuiește cactusi au dat lumii culoarea roșie

_ ADN-ul antic dezvăluie apariția unui împărat chinez din secolul al VI-lea

_ Studiul ADN identifică descendenții lui George Washington din rămășițe nemarcate


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23

Nr. de articole la aceasta sectiune: 1357, afisate in 23 pagini.