20:32 2024-02-27
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Instrumentele de calcul inovatoare oferă noi perspective asupra genomului de grâu poliploid
_ Instrumentele de calcul inovatoare oferă noi perspective asupra Genomul de grâu poliploid
O nouă revizuire condusă de profesorul asociat Weilong Guo (Colegiul de Agronomie și Biotehnologie, China Agricultural University, Beijing, China) explorează genomul poliploid de grâu prin noi instrumente de calcul. Cercetarea este publicată în jurnalul aBIOTECH.
Grâul de pâine este alohexaploid, iar genomul său are o dimensiune de aproximativ 16 Gb, unul dintre cei mai mari genomi din culturi. Analiza unor astfel de date genomice masive, cum ar fi identificarea variațiilor genetice și înțelegerea funcțiilor genelor, necesită costuri ridicate, precum și instrumente de calcul robuste și eficiente.
În plus, poliploidizarea, variantele genomice frecvente și resursele genomice complexe limitează și mai mult. studiul genomicii funcționale a grâului. Aceste provocări necesită proiectarea și dezvoltarea de noi instrumente de calcul pentru abordarea genomurilor complexe.
Prin țintirea caracteristicilor și provocărilor unice ale genomului de grâu poliploid și disecând date de la mai multe niveluri omice, cercetătorii au dezvoltat recent un serie de instrumente genomice pentru a dezvălui variația genomică și funcția genelor. Bazele de date genomice sau serverele web au fost dezvoltate în continuare pentru ca utilizatorii să acceseze convenabil aceste date fără programare.
În plus, sunt furnizate o serie de exemple pas cu pas pentru a ilustra modul în care aceste instrumente sau baze de date pot fi utilizate pentru disecarea resurselor de germoplasmă de grâu și dezvăluirea genelor funcționale și a reglementărilor asociate cu trăsături agronomice importante. Conductele și comenzile pentru exemplele pas cu pas sunt disponibile la http://wheat.cau.edu.cn/resources/tutorial.html.
Revizuirea discută, de asemenea, viitoarele inovații potențiale în proiectare algoritmi genomici, dezvoltarea de instrumente și construirea unei baze de date pentru culturi cu genomi complexe, în ceea ce privește variația genomică, evoluția genelor, reglarea genelor, plasticitatea poliploidului și reproducerea prin proiectare. Utilizarea unor instrumente și baze de date eficiente și de înaltă performanță va conduce la o transformare a tehnologiilor de ameliorare a grâului, sporind astfel dezvoltarea de soiuri superioare de grâu pentru a satisface cererea crescândă de alimente a populației în creștere în condiții climatice în continuă schimbare.
Comentarii:
Adauga Comentariu