19:37
Comentarii Adauga Comentariu

_ Supracalcularea secretelor din interiorul antibioticelor pentru bovine

_ Supercalcularea secretelor din interiorul antibioticelor pentru bovine

Chimiștii au determinat pentru prima dată structura cristalină a unei componente cheie a enzimei monensin și au deblocat mecanismul activității sale de reacție.

„Descoperirea principală a fost primul cristal. structura pentru această familie de enzime”, a spus Chu-Young Kim, profesor de biochimie la Universitatea din Illinois Urbana-Champaign (UIUC), care a condus partea experimentală a studiului. El și colegii săi au rezolvat structura cristalină pentru MonCI, o enzimă cheie în bacteriile din sol care sintetizează în mod natural monensina.

Lela Vukovic, profesor asociat la Universitatea din Texas, la El Paso (UTEP), a efectuat calculul. studii privind cercetarea monensin, publicate în Nature Communications.

Inițiativa University of Texas Research Cyberinfrastructure (UTRC) a acordat alocații de supercomputer Vukovic pe sistemul Lonestar6 la Centrul de calcul avansat din Texas (TACC) pentru a face față acestor provocări. UTRC oferă capabilități de calcul avansate cercetătorilor din toate cele 14 instituții ale sistemului UT.

Lonestar6 de la TACC a ajutat la dezvăluirea secvenței de reacție care produce monensin. Această cercetare deschide ușa pentru proiectarea viitoare a antibioticelor mai sigure și mai eficiente.

„Am descoperit că MonCI este folosit pentru a efectua trei reacții cruciale de epoxidare”, a spus Kim. „Acest lucru este foarte neobișnuit și are implicații asupra modului în care putem proiecta bacteria pentru a produce noi antibiotice.”

Kim, care a părăsit recent UTEP pentru a se alătura UIUC, a consultat laboratorul lui Vukovic cu rezultatele structurii și plin de întrebări noi. . Ceea ce a găsit a fost o reacție secvenţială interesantă în interiorul enzimei. Cu toate acestea, a fost încă imposibil din punct de vedere experimental să se obțină structura cristalină a enzimei cu substratul în interior în modul său activ.

Aceasta a fost momentul în care Kim și Vukovic au decis să modeleze enzima și substarea în simulări când substratul este stabil. . Dacă un substrat este stabil într-o anumită poziție, atunci poate apărea o reacție pentru acea poziție.

Vukovic și studenții ei Tara Nitka și Anju Yadav au dezvoltat modele complete ale sistemului de aproximativ 78.000 de atomi bazate pe structurile cristaline. determinate de experimentaliştii studiului.

„Provocările de calcul au apărut din examinarea mai multor sisteme pentru a determina poziția în care premonensina A și versiunile sale epoxidate sunt cele mai stabile și cel mai probabil să sufere prima, a doua și a treia reacție de epoxidare. ”, a spus Vukovic.

„Supercalculatoarele au fost foarte utile în caracterizarea acestor molecule biologice care produc în mod natural antibiotice”, a adăugat Vukovic. „Nu am fi capabili să realizăm studiile computaționale fără ele. Studiile computaționale ne ajută să descoperim și să înțelegem aceste reacții secvențiale complexe importante pentru societate.”

Vukovic și-a efectuat cercetările postdoctorale la UIUC sub defunctul Klaus Schulten, a cărui moștenire trăiește în software-ul NAMD dezvoltat de grupul său și a fost folosit în acest studiu și în nenumărate altele.

„UIUC depune multă muncă pentru a optimiza NAMD să ruleze pe supercalculatoarele naționale, cum ar fi Lonertar6 și Stampede2 la TACC”, a spus ea. „NAMD ne-a permis să mărim această enzimă și să vedem ce reacții au loc prima, a doua și a treia pentru a genera monensin.”

„Biosinteza monensinului necesită cel puțin 14 enzime diferite, dintre care una este MonCI”, Kim. adăugat. „Trebuie să investigăm, de asemenea, toate celelalte enzime. În viitor, ne așteptăm să generăm versiuni îmbunătățite de monensin pentru a avea grijă mai bine de bovine și păsări de curte. În plus, monensinul este toxic pentru cai și câini, astfel încât aceste animale de fermă sunt uneori otrăvite accidental. și ucis. Prin urmare, este nevoie de un monensin netoxic."

Autorii sunt Qian Wang, Tara A. Nitka, Anju Yadav și Lela Vukovic de la Universitatea Texas din El Paso; Ning Liu, Hongli Xiao, Hui Yang și Xi Chen de la Universitatea Northwest, China; Irimpan I. Mathews de la SLAC National Accelerator Laboratory; și Chu-Young Kim de la Universitatea din Illinois Urbana-Champaign.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

_ Urmăriți: KJP �ncearcă să-l �nchidă pe Peter Doocy de la Fox pentru că l-a �ntrebat de ce Biden vorbește cu oamenii morți

_ MIKE JOHNSON �N PROBLEME: Reprezentantul Thomas Massie anunță că �și va uni forțele cu MTG pentru a-l �nlătura din funcția de vorbitor � Johnson �și poate permite doar să piardă un vot GOP

_ Moderna �nregistrează pierderi de 1,2 miliarde de dolari pe măsură ce cererea pentru COVID Jab se prăbușește, promite investitorilor un vaccin de �generația următoare� pentru a combate noile tulpini

_ De ce programe de slăbit foarte utile în cazul unora, eșuează lamentabil la alții?

_ Lucrător IT „care și-a ucis șeful milionar și soțul ei otrăvindu-i cu fentanil” a spus poliției că este predispusă la supradoze.

_ Papa Francisc va vizita câteva țări din Asia

_ 'Era un bărbat de doamne!' Cum era cu adevărat vedeta Baby Reindeer

_ Școlile închise, avertismente emise pe măsură ce Asia se înăbușește într-un val de căldură extrem

_ CAROLINE WEST-MEADS: „Partenerul prietenului meu o folosește ca bilet de masă”

_ Cum valurile și amestecul determină sistemele de revărsare de coastă

_ HORROR: Un american și frați australieni uciși �n timpul unei călătorii de surf �n Mexic, hoții �și aruncă trupurile �ntr-o f�nt�nă ad�ncă de 50 de picioare

_ Atenţionare de călătorie: Cod roşu de valuri mari şi vânt în Portugalia

_ Politica de predare a cuțitului zombi de la Labor, care oferea compensații pentru lamele avea „defecte uriașe” și putea costa până la 1,1 MILIOANE de lire sterline

_ Filmul „Sleeping Dogs”, cu Russell Crowe, bazat pe o carte a unui autor român, are premiera în SUA

_ Studentă suspendată după ce protestul anti-Israel s-a pl�ns că se confruntă cu consecințe pentru acțiunile ei

_ Ilan Şor a declarat că Republica Moldova ar trebui să coopereze cu Uniunea Economică Eurasiatică pentru dezvoltarea economiei

_ Se schimbă tot ceea ce se știa până acum: Ar putea exista viață pe 'Luna' lui Jupiter. NASA a prezentat sonda care ar putea descoperi acest lucru / VIDEO

_ Cei mai în vârstă gemeni siamezi, Lori şi George Schappell, s-au stins la vârsta de 62 de ani

_ Fotbalul poate fi crud, a afirmat selecţionerul Africii de Sud după eliminarea de la Cupa Africii pe Naţiuni

_ Percheziții la Primăria Ploiești - Mai mulți funcționari vor fi duși la audieri (surse)

_ Video | Accident teribil în Constanța. Sunt doi morți

_ URMĂȚI: Un deputat din Georgia înregistrează un videoclip cu străini ilegali ascunși într-o cameră ascunsă, sub protecție militară, pe aeroportul din Atlanta

_ Programele de transformare au şanse de reuşită de 12 ori mai mari prin concentrarea pe factorul uman

_ LIVE TEXT - Război în Ucraina: Kievul anunță că și-a triplat producția de arme

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

_ UE îşi propune să lanseze o misiune navală în Marea Roşie până la jumătatea lunii februarie

_ Gavin Newsom spune că democrații trebuie să fie îngrijorați de candidații terților în 2024 (VIDEO)

_ Gigi Becali se teme de Ion Ţiriac! Nu mai are nicio şansă în faţa magnatului. Îi va lua faţa imediat

_ Ciucă, replică pentru Ciolacu după ce premierul a ironizat județul condus de Gheorghe Flutur: PNL a arătat că este partidul cu cei mai eficienţi aleși locali

_ În partea a treia a noului roman de neratat al autorului One Day David Nicholls, capul lui Marnie este întors de un străin enigmatic. Conrad era cel mai frumos bărbat pe care l-a văzut vreodată - dar nu știa el...

_ „Voi, americanii, sunteți fascinați de putere”

_ CHIAR ÎN: Rep. Tim Burchett trimite o scrisoare Comitetului de Supraveghere al Camerei, solicitând investigarea scrisorilor democraților către companii private prin care le cere să cenzureze mass-media conservatoare și One America News Network

_ O pierdere pentru lumea modei: Iris Apfel s-a stins la vârsta de 102 ani

_ Secretarul de Externe David Cameron spune că este „profund îngrijorat” de planurile Israelului de a invada Rafah

_ Doi adulți au fost identificați și acuzați �n cadrul unei �mpușcături la parada din Kansas City � Autoritățile refuză să numească tinerii �narmați aflați �n prezent �n custodie

_ Marea Britanie nu mai este destinaţia favorită a investitorilor hotelieri: Spania este noua perlă

_ Femeie grav rănită după ce a fost atacată de câinele ei de talie mare, în curtea casei

_ Echipa feminină de tenis de masă a României, calificată la Jocurile Olimpice de la Paris

_ Înțelegerea acidului iasmonic: un comutator care activează autofagia în petalele de Arabidopsis

_ 'Doar un idiot ar vota' - Trump cere respingerea în Congresul SUA a legii care acordă Ucrainei și Israelului miliarde de dolari

_ MOVEMENT BUILS pentru a-l �ndemna pe reprezentantul Mike Gallagher să demisioneze �nainte de 9 aprilie pentru a stimula alegeri speciale � sau scaunul va fi lăsat deschis p�nă �n ianuarie! �MTG conduce acuzația!

JD Vance, vicepreședintele SUA, mesaj dur în apărarea lui Călin Georgescu: Alegerile din România au fost anulate pe baza unor suspiciuni nefondate ale unei agenții de informații și a presiunii UE -

_ Algeria's 'foggara' irrigation system: How farmers keep oases green

_ Am păzit unii dintre cei mai cunoscuți prizonieri ai Marii Britanii - de aceea este GREȘIT să-l țin pe „Hannibal Canibalul” Robert Maudsley închis într-o temniță de sticlă

_ Cine este soția lui Dave Myers, Liliana Orzac? Faceți cunoștință cu femeia „remarcabilă” care l-a susținut pe starul Hairy Biker în călătoria sa „teribilă” împotriva cancerului

Prăbușirea demografică a României se datorează în integralitatea partidelor sistemului care au condus România 35 de ani

_ Moment dramatic, stăpânul supărat de animal de companie îi ordonă lui Rotweiller să-și atace vecinul în vârstă de alăturat doar pentru a ajunge să-l muște pe pensionar EȘASA - când câinele refuză

_ Primul genom complet al unui șarpe ajută la înțelegerea istoriei sale evolutive

_ Supărare mare - se anunța o lansare cu scântei a candidaților USR

_ Forţele americane şi britanice efectuează noi lovituri împotriva Houthis în Yemen

_ Record de beneficiari de ajutor social în decembrie 2023

_ Man United „a luat deja o decizie în privința lui Erik ten Hag” - și va fi demis chiar dacă câștigă Cupa FA, sugerează Alan Shearer, în timp ce dezvăluie cei doi indicatori mari care arată că demiterea este iminentă

_ Ministru 'remaniat' de propriii copii. Scandal în guvernul scoțian

_ Porii foarte mici fac o mare diferență în tehnologia de filtrare

_ Toate porturile de la Marea Neagră, închise din cauza vântului

_ Atacul asupra consulatului iranian. Ambasadorul Iranului în Siria spune că răspunsul va fi „dur”

Ce este o Lovitură de Stat? A fost împiedecat Călin Georgescu să devină duminică seara pe 6 Decembrie 2024, Președintele României, printr-o lovitură de stat?

_ Creșterea trișorilor microbieni în medii limitate de fier: Studiul dezvăluie istoria lor evolutivă

_ Secretarul pentru Muncă �interimar� al lui Biden r�de de milioane de americani care cred că le-au fost mai bine sub Trump (VIDEO)

_ FC Barcelona: Joan Laporta a acceptat decizia antrenorului Xavi de a părăsi banca tehnică la finele sezonului


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36 Pag.37 Pag.38 Pag.39
Pag.40 Pag.41 Pag.42 Pag.43 Pag.44 Pag.45 Pag.46 Pag.47
Pag.48 Pag.49 Pag.50 Pag.51 Pag.52

Nr. de articole la aceasta sectiune: 3101, afisate in 52 pagini.