16:39 2024-03-20
science - citeste alte articole pe aceeasi tema
Comentarii Adauga Comentariu
_ Noi perspective privind reglarea transcripțională a germinării semințelor
_ Noi perspective privind reglarea transcripțională a germinării semințelor
Semințele rămân în stare de repaus, așteptând să germineze condițiile de mediu potrivite, crescând astfel probabilitatea de supraviețuire a răsadului fragil. Trecerea de la o sămânță uscată la un răsad vegetativ este un proces ireversibil care necesită o reprogramare aproape completă a transcriptomului plantei. Deși este larg acceptat că activarea sintezei (traducerii) proteinelor din ARNm stocate în semințe este un pas esențial pentru a declanșa germinarea semințelor, se cunoștea mult mai puțin despre reinițializarea procesului de transcripție.
O echipă de cercetători de la Centrul de Cercetare în Genomica Agricolă (CRAG), condusă de Julia Qüesta, s-a angajat să investigheze problema când reîncepe transcripția în timpul tranziției de la sămânță la răsad.
Grupul a aplicat inovatoare. Metodologii de secvențiere a ARN și bio-imagini pentru a monitoriza dinamica sintezei noi de ARN (transcripție naștere) într-un curs de timp al germinării semințelor și al creșterii timpurii a răsadurilor folosind planta model Arabidopsis thaliana. Această abordare combinată a permis detectarea transcripției ARN foarte rapid după rehidratarea semințelor (imbibiție), ceea ce implică faptul că transcripția reîncepe mult mai devreme decât se anticipa anterior.
În plus față de momentul transcripției, sensibilitatea metodele utilizate au permis identificarea a mii de ARN-uri necodificatoare neadnotate anterior, inclusiv ARN-uri necodificatoare lungi intergenice și antisens (lncRNA-uri), precum și transcripte necodante foarte instabile. Aceste descoperiri vor deschide probabil noi căi de investigare a rolului de reglementare al genomului necodant în controlul germinării semințelor.
În a doua fază a lucrării, autorii au generat seturi de date privind accesibilitatea cromatinei la nivelul întregului genom pentru același curs al timpului de germinare.
Prin filtrarea transcrierilor instabile necodificatoare care au căzut în regiunile de cromatină accesibile din genom, autorii au reușit să detecteze caracteristici de reglementare importante, cum ar fi transcripția bidirecțională și potențiatorii transcripționali. Până în prezent, nu a fost clar dacă elementele de amplificare a plantelor au fost transcrise producând ARN amplificatori, o caracteristică binecunoscută a amplificatorilor la animalele multicelulare.
Această cercetare publicată în Nature Communications descrie identificarea elementelor de amplificare a Arabidopsis, care va fi probabil de mare interes în plantele cu valoare agronomică.
Comentarii:
Adauga Comentariu