17:36
Comentarii Adauga Comentariu

_ Grund unic degenerat îmbunătățește semnificativ performanța codurilor de bare COX1 în profilarea nematodelor din sol

_ Grund unic degenerat semnificativ îmbunătățește performanța codurilor de bare COX1 în profilarea nematodelor din sol

Nematozii microscopici joacă roluri importante în ecosistemul solului și servesc adesea ca bioindicatori ai sănătății solului. Identificarea nematozilor din sol este adesea dificilă din cauza caracterelor lor de diagnostic limitate și a plasticității fenotipice ridicate. Tehnicile de codare de bare și metabarcoding ADN sunt promițătoare, dar lipsesc primeri universali, în special pentru gena COX1 mitocondrială.

Într-un nou studiu, a fost dezvoltat un primer COIFGED degenerat COX1. Perechea de primeri COIFGED/JB5GED a îmbunătățit semnificativ identificarea speciilor și, prin urmare, poate fi suplimentară sau alternativă la metabarcoding 18S convențional. Descoperirile cercetătorilor au fost publicate în Soil Ecology Letters.

O serie de studii privind metabarcodingul nematodelor din sol au fost efectuate de către laboratorul Plant Nematode de la Universitatea de Agricultură din Nanjing și au fost obținute multe descoperiri interesante. De exemplu, o proporție din ASV non-Nematoda a fost atribuită eucariotelor din sol, cum ar fi Arthopoda și Ascomycota. Aceste organisme pot reprezenta o parte din microbiomul intestinal al nematodelor, deoarece nematozii din sol se hrănesc cu o mare varietate de surse de hrană, în mod alternativ, resturile lor degradate pot fi transportate de cuticulele nematodelor.

Cercetătorii au descoperit, de asemenea, că abundența relativă recuperată din metabarcoding. datele nu au fost proporționale cu observația morfologică. Variabilitatea acestor abundențe recuperate poate fi atribuită distorsiunilor primerului, deoarece unor taxoni de nematozi le lipsește un site adecvat de legare a primerului din cauza mutațiilor în regiunile de legare a primerului, în special pentru genele COX1.

Profesor Qing. a spus: „Am proiectat patru site-uri degenerate în primer cu două N (conține toate cele patru nucleotide) în situsuri hiper-variabile, cu scopul de a îmbunătăți eficiența de legare a primerului pentru gena COX1 hiper-variabilă”. Împreună cu primerul invers existent JB5GED, noua pereche de primeri depășește pe scară largă primerii JB3/JB4.5 folosiți în mod obișnuit atât în ​​ceea ce privește recuperarea mai largă a taxonilor, cât și producția mai mare de ampliconi.

„Am observat o proporție semnificativă de ASV neidentificate, alții. li s-au atribuit taxoni neaștepți, ceea ce a dus la nerecuperarea multor taxoni comunitari simulați.Pe baza unei reconstrucții filogenetice, am confirmat că multe dintre ASV-urile neidentificate aveau origine nematodă, subliniind importanța acoperirii bazei de date și o muncă cuprinzătoare care va trebui să aibă loc pentru extinderea bazei de date a nematodelor COX1. înainte ca gena COX1 să poată fi utilizată ca marker de metabarcoding.”

În prezent, condus de o reprezentare largă a taxonilor în bazele de date, ARNr-ul 18S a fost cel mai frecvent utilizat marker al genei de codare de bare. Cu toate acestea, s-a demonstrat că ARNr 18S oferă o rezoluție taxonomică limitată, în special la nivel de specii sau chiar de gen pentru unele grupuri de nematozi. Gena COX1 mitocondrială hipervariabilă este o genă potrivită pentru a discrimina specii strâns înrudite sau chiar grupuri filogeografice dintr-o singură specie. Primerul COX1 nou proiectat a îmbunătățit semnificativ eficiența de legare și, prin urmare, poate fi suplimentar la metabarcoding 18S convențional în viitor.


(Fluierul)


Linkul direct catre Petitie

CEREM NATIONALIZAREA TUTUROR RESURSELOR NATURALE ALE ROMANIEI ! - Initiativa Legislativa care are nevoie de 500.000 de semnaturi - Semneaza si tu !

Comentarii:


Adauga Comentariu



Citiți și cele mai căutate articole de pe Fluierul:

Prăbușirea demografică a României se datorează în integralitatea partidelor sistemului care au condus România 35 de ani

_ Victor reacționează: Fools Love Affair, Fani Willis și procurorul șef recunosc că au o relație sexuală (VIDEO)

_ DEZVOLTARE: SUA oprește finanțarea agenției ONU �n urma acuzațiilor de implicare a angajaților �n masacrul din Israel din 7 octombrie

Bilderbergul Macron: UE poate sprijini Ucraina fără aprobarea Rusiei trimițând mii de soldați din fiecare țară a UE.

Editorial Cornel Dinu. SMINTEALA clasei politice înaintea unor alegeri prezidențiale compromise din start

Pieleanu "face" sondaje "la refefon"

_ Peștii adulți se luptă să revină în zonele marine protejate, arată studiul

_ Performanța de la Super Bowl a imnului național al negru provoacă reacții pe rețelele sociale

_ Prima exoplanetă super-Pământ blocată în mod curent a fost confirmată

_ Creștini supărați se ciocnesc cu poliția australiană după ce au �njunghiat liderul și credincioșii la biserica Wakeley: �Adu-l afară� (VIDEO)

_ FMI aprobă noi fonduri pentru Argentina din Milei, laudă planurile ambițioase, recunoaște „moștenirea dificilă” de la socialiștii peronişti

_ Florin Călinescu: Este o mizerie umană ce a făcut Iohannis cu postul de profesor

_ Democratul Dean Phillips participă la un miting al lui Trump � spune CNN că a fost uimit de c�t de prietenoși erau oamenii (VIDEO)

_ Joe Hoft se angajează într-un nou capitol prin lansarea JoeHoft.com

_ MAGA SE LUPTE! Protestatarii Anti-Trump DEMASCAȚI ȘI EXPULȚIȚI din miting | Top 5 al lui Elijah Schaffer (VIDEO)

_ Tot ce poate merge prost cu sânii tăi - și ce să faci în privința asta: ghidul definitiv al DR PHILIPPA KAYE

_ Oklahoma GOP adoptă o rezoluție de condamnare și cenzură a senatorului James Lankford pentru un acord scandalos la frontieră

_ ICCJ face precizări fulger despre cum se aplică arestul preventiv: Sunt vizați toți suspecții cu dosar pe rol!

_ Tensiuni între Israel şi Iran. Armata israeliană blochează toate concediile militarilor

_ Gabriela Firea face teoria fericirii și evită să pronunțe numele candidatului PSD-PNL la Capitală/ VIDEO

_ Director executiv al aeroportului Bill și Hillary Clinton din Arkansas împușcat în cap de agenți federali după ce ar fi deschis focul

_ BANANA REPUBLIC: Juriul de la Tribunalul Merchan’s Kangaroo l-a găsit pe Trump vinovat de 34 de infracțiuni – dar NU A SPECIFICAT ce crimă a comis Trump – NIMENI NU ȘTIE! (VIDEO)

_ Maignan „senin și puternic” în ciuda abuzurilor, spune antrenorul AC Milan

_ Descinderi unice ale polițiștilor din Spania: O bandă de hoți de lux, formată din foști militari, a fost destructurată

Micul Stalinist Nicușor Soros Dan ne spune că a&i lua unui om dreptul de a candida și milioanelor de români dreptul de a-l vota fără o condamnare "e o decizie corectă". Poate in URSS-ul lui Lenin, plicușor cu bani de la Soros

Mișcarea Suveranistă e împărțită între "Turul Doi Inapoi" și "Sa mergem înainte cu Simion". Simion și Ana Maria Gavrilă trebuie sa sustina Rolul Important a lui Călin Georgescu în Statul Român dacă vor să castige

Așadar dacă pacea se va încheia Nikolaev și Odessa vor rămâne în Ucraina, în sfera de influență Americană. Putin nu va revendica Odesa dacă americanii recunosc Crimeea, Donețk, Lugansk, Zaporojie și Herson ca părți ale Rusiei

Viktor Orbán: "Nu mai puteam să stăm cu mâinile în sân şi să privim cum lanţurile de magazine jefuiesc oamenii". Vă amintiți cum au sărit Soroșiștii pe Călin Georgescu când ne-a spus că Multinaționalele ne jefuiesc? De ce AUR și Simion TAC pe această temă?

În sondajul Atlas Intel Soroșiștul Nicușor Dan, e pe locul doi

Ramurile Cominterniste directe sau prin alianță se susțin între ele. Celebrul Bombonel, alias Adrian Năstase, care a dat petrolul țării și multe alte bunuri naționale pe Nimic, îl susține pe Victor Ponta. Nu ai nenorocit destul țara asta Bombonele?

Adrian Onciu: Cine sunt, de fapt, extremiștii

De ce sa înjuri votanții că votează cu cine vor ei? Tonomatul puterii pe nume Ciutacu care pupă la greu poala Pucistului Ciolacul și a lui Gold Corporation Ponta ii înjură oribil pe votanții lui Georgescu

Sorosistul Securistoid Bănescu noua Față Hidoase a Cenzurii Regimului UEist de la București

Cazul Le Pen, ineligibilitate și executare provizorie: ce spune cu adevărat legea

ActiveNewx - Bolojan și-a adus la Palat "societatea civilă" SOROS după modelul Iohannis pentru a discuta combaterea ”știrilor false” înainte de alegeri, adică perfecționarea cenzurii

Prăbușirea criptomonedelor TerraUS și LUNA s-a datorat unui grup restrâns de speculanți care au pariat "short"

Motivarea judecatorului

_ Întrebări și răspunsuri: O boală misterioasă se răspândește printre câini la nivel național. Iată ce trebuie să știți

_ Vremea se schimbă din nou în România! Când vine frigul

_ Oamenii de știință descoperă că Luna se micșorează, provocând alunecări de teren și instabilitate în polul sud lunar

_ Companie care oferă păpuși sexuale personalizate asemănătoare copiilor, acum promovează bestialitatea și oferă păpuși sexuale pentru câini pentru zoofili

_ Guvernul �n prăbușire al Haitiului formalizează un nou Consiliu de tranziție neales, dar birocrația persistă, �n timp ce premierul �n deplasare Henry este acuzat că a �ncercat să-și păstreze puterea

_ Oficialul FDNY care a vrut să �v�neze� angajații care au huiduit-o pe Letitia James, este chinuit la paradă: �Suck!� (VIDEO)

_ Haaland a părăsit şchiopătând un antrenament al echipei Norvegiei

_ Patronatul Român al Industriei Suplimentelor Alimentare cere Ministerului Sănătății să adopte cât mai rapid Normele de aplicare a Legii suplimentelor alimentare

_ Rezultat tragic: un copil de trei săptămâni găsit mort după ce democrații i-au permis custodia tatălui unui dependent fără adăpost

_ Mai multe dovezi despre Dirty Leaker în interiorul echipei de tranziție a lui Trump – Cu o vendetta împotriva lui Pete Hegseth

_ DeSantis pune capăt odată pentru totdeauna ��nșelătoriei de ocupători� prin semnarea unei noi legi

_ Un act de echilibru: EphB4 și ephrin-B2 reglează formarea arterelor

_ „America’s Top Ten Countdown” cu Wayne Allyn Root, difuzat în fiecare sâmbătă la prânz ET pe Rețeaua de televiziune vocală din Real America (VIDEO)

_ O femeie din New York, în vârstă de 26 de ani, care a salvat un porumbel de companie, dezvăluie cum a „dresat-o la oliță” pasărea să folosească o WC – și acum o duce cu ea într-o poșetă oriunde merge, de la baruri și restaurante până la AVIONURI.

_ Charlotte, virgin stingray crește ceva în afară de copii, dezvăluie îngrijitorii ei

_ Ar putea AI să declanșeze războiul nuclear?

_ Degradarea perechii de pete solare elucidează proprietățile caracteristicilor magnetice în mișcare din apropiere

Fluierul Ro face un apel disperat către oamenii Sistemului care conduc România să nu repete greșelile Statului Român din anii 1939-1940 când țara s-a destrămat

_ Accident în judeţul Braşov. Şapte autoturisme au fost implicate

_ Avocat constituțional și profesor emerit, Facultatea de Drept din Harvard, Alan Dershowitz, �i amenință pe �antisemiții� din campusurile universitare cu legea � spune că este necesar pentru a descuraja genocidul evreilor

_ FDA admite că vaccinul �mpotriva COVID duce la un risc �semnificativ crescut� de convulsii la copiii mici

_ FOTO – Nicușor Dan 'fură meserie' de la Traian Băsescu: a propus o întâlnire în piață / 'Ne vedem pe 9 iunie aici'

_ Geoingineria poate încetini pierderea calotei de gheață din Groenlanda, arată un studiu de modelare


Pag.1 Pag.2 Pag.3 Pag.4 Pag.5 Pag.6 Pag.7
Pag.8 Pag.9 Pag.10 Pag.11 Pag.12 Pag.13 Pag.14 Pag.15
Pag.16 Pag.17 Pag.18 Pag.19 Pag.20 Pag.21 Pag.22 Pag.23
Pag.24 Pag.25 Pag.26 Pag.27 Pag.28 Pag.29 Pag.30 Pag.31
Pag.32 Pag.33 Pag.34 Pag.35 Pag.36 Pag.37 Pag.38 Pag.39
Pag.40 Pag.41 Pag.42 Pag.43 Pag.44 Pag.45 Pag.46 Pag.47
Pag.48 Pag.49 Pag.50 Pag.51 Pag.52 Pag.53 Pag.54 Pag.55
Pag.56 Pag.57 Pag.58 Pag.59 Pag.60 Pag.61 Pag.62 Pag.63
Pag.64 Pag.65 Pag.66 Pag.67 Pag.68 Pag.69 Pag.70 Pag.71
Pag.72 Pag.73 Pag.74 Pag.75 Pag.76 Pag.77 Pag.78 Pag.79
Pag.80 Pag.81 Pag.82 Pag.83 Pag.84 Pag.85 Pag.86 Pag.87
Pag.88 Pag.89 Pag.90 Pag.91 Pag.92 Pag.93 Pag.94 Pag.95
Pag.96 Pag.97 Pag.98 Pag.99 Pag.100 Pag.101 Pag.102 Pag.103
Pag.104 Pag.105 Pag.106 Pag.107 Pag.108 Pag.109 Pag.110 Pag.111
Pag.112 Pag.113 Pag.114 Pag.115 Pag.116 Pag.117 Pag.118 Pag.119
Pag.120 Pag.121 Pag.122 Pag.123 Pag.124 Pag.125 Pag.126 Pag.127
Pag.128 Pag.129 Pag.130 Pag.131 Pag.132 Pag.133 Pag.134 Pag.135
Pag.136 Pag.137 Pag.138 Pag.139 Pag.140 Pag.141 Pag.142 Pag.143
Pag.144 Pag.145 Pag.146 Pag.147 Pag.148 Pag.149 Pag.150

Nr. de articole la aceasta sectiune: 8951, afisate in 150 pagini.